| 2021 |
Artigo em periódico |
Ten Complete Mitochondrial Genomes of Gymnocharacini (Stethaprioninae; Characiformes). Insights Into Evolutionary Relationships and a Repetitive Element in the Control Region (D-loop)
Pasa RUBENS; Fabiano Bezerra MENEGIDIO; Rodrigues Oliveira Igor HENRIQUE; Da Silva Iuri BATISTA; De Campos Matheus Lewi Cruz BONACCORSI et al
FRONTIERS IN ECOLOGY AND EVOLUTION
DOI 10.3389/fevo.2021.650783
ISSN 2296-701X
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LS
Ecology; Evolution; Behavior and Systematics
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| 2021 |
Artigo em periódico |
Analysis of mouse faecal dysbiosis; during the development of cachexia; induced by transplantation with Lewis lung carcinoma cells
De Maria Yara N L F; Aciole Barbosa DAVID; Fabiano Bezerra MENEGIDIO; Santos Kaltinaitis B N H; Humberto Ana CAROLINA et al
MICROBIOLOGY-SGM
DOI 10.1099/mic.0.001088
ISSN 1350-0872
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LS
Microbiology
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| 2021 |
Artigo em periódico |
Transcriptomic Profiling and Microsatellite Identification in Cobia (Rachycentron canadum); Using High-Throughput RNA Sequencing
Aciole Barbosa DAVID; Araújo Bruno C; Branco Giovana SOUZA; Simeone Alexandre S; Hilsdorf Alexandre W S et al
MARINE BIOTECHNOLOGY
DOI 10.1007/s10126-021-10081-0
ISSN 1436-2228
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LS
Aquatic Science
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| 2020 |
Trabalho em evento |
Among Genera: A phylogenetic inference with mitogenomes of nine species of Stethaprioninae (Characidae; Characiformes)
Matheus Lewi Cruz Bonaccorsi De CAMPOS; Iuri B SILVA; Dinaiza A Rocha REIS; Fabiano Bezerra MENEGIDIO; Trude SCHWARZACHER et al
X-meeting eXperience 2020
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LS
Ecology; Evolution; Behavior and Systematics
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| 2020 |
Trabalho em evento |
Ten complete mitochondrial genomes of gymnocharacini (Stethaprioninae; Characiformes)
Matheus Lewi Cruz Bonaccorsi De CAMPOS; Iuri B SILVA; Igor H Rodrigues OLIVEIRA; Dinaiza A Rocha REIS; Fabiano Bezerra MENEGIDIO et al
X-meeting eXperience 2020
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LS
Molecular Biology
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| 2020 |
Trabalho em evento |
De novo transcriptome assembly and functional annotation of cobia (Rachycentron canadum) liver
Aciole Barbosa DAVID; Bruno Cavalheiro ARAUJO; Alexandre Wagner Silva HILSDORF; Luiz R NUNES; Renata G MOREIRA et al
X-meeting eXperience 2020
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LS
Molecular Biology
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| 2020 |
Artigo em periódico |
Transcriptomic profiling identifies novel transcripts; isomorphs; and noncoding RNAs in Paracoccidioides brasiliensis
Fabiano Bezerra MENEGIDIO; Aciole Barbosa DAVID; Alencar Valquíria C; Vilas Boas Renata O; Costa De Oliveira REGINA et al
MEDICAL MYCOLOGY
DOI 10.1093/mmy/myaa062
ISSN 1369-3786
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LS
Microbiology
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| 2020 |
Artigo em periódico |
Complete mitochondrial genome of the endangered species Brycon nattereri (Characiformes; Characidae)
Resende Snaydia VIEGAS; Pasa RUBENS; Fabiano Bezerra MENEGIDIO; Heslop Harrison John Seymour PAT; Schwarzacher TRUDE et al
F1000RESEARCH
DOI 10.12688/f1000research.26524.1
ISSN 2046-1402
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LS
Animal Science and Zoology
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| 2020 |
Artigo em periódico |
The Complete Mitochondrial Genome of Two Armored Catfish Populations of the Genus Hypostomus (Siluriformes; Loricariidae; Hypostominae)
Rocha Reis Dinaíza ABADIA; Pasa RUBENS; Fabiano Bezerra MENEGIDIO; Heslop Harrison John SEYMOUR; Schwarzacher TRUDE et al
FRONTIERS IN ECOLOGY AND EVOLUTION
DOI 10.3389/fevo.2020.579965
ISSN 2296-701X
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LS
Ecology; Evolution; Behavior and Systematics
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| 2020 |
Artigo em periódico |
Fungal Dysbiosis Correlates with the Development of Tumor-Induced Cachexia in Mice
Jabes Daniela L; De Maria Yara N L F; Aciole Barbosa DAVID; Santos Kaltinaitis B N H; Carvalho Lucas M et al
JOURNAL OF FUNGI
DOI 10.3390/jof6040364
ISSN 2309-608X
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HS
Oncology
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| 2019 |
Trabalho em evento |
Complete mitochondrial genome of Astyanax altiparanae (Characiformes; Characidae)
Matheus Lewi Cruz Bonaccorsi De CAMPOS; Rubens PASA; Fabiano Bezerra MENEGIDIO; Js Pat Heslop HARRISON; Trude SCHWARZACHER et al
65º Congresso Brasileiro de Genética
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LS
Genetics
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| 2019 |
Trabalho em evento |
Characterization of the fungal gut population (mycobiota) in an experimental murine model of cancer cachexia
Aciole Barbosa DAVID; Fabiano Bezerra MENEGIDIO; Faustino De Maria Yara Natércia LIMA; Gonçalves Rafael Dos S; Kaltinaitis Benetton Nunes Hypolito Dos SANTOS et al
65º Congresso Brasileiro de Genética
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HS
Oncology
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| 2019 |
Trabalho em evento |
Alterations in gut microbiota verified in an experimental murine model of cancer cachexia
Faustino De Maria Yara Natércia LIMA; Fabiano Bezerra MENEGIDIO; Aciole Barbosa DAVID; Gonçalves Rafael Dos S; Kaltinaitis Benetton Nunes Hypolito Dos SANTOS et al
65º Congresso Brasileiro de Genética
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LS
Cancer Research
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| 2019 |
Trabalho em evento |
Characterization of promoter elements responsive to the quorum sensing (qs) auto-inducer 2 (ai-2) in Zymomonas mobilis
Vilas Boas Renata OZELAMI; Alencar Valquíria CAMPOS; V M FARNÉZIO; Aciole Barbosa DAVID; Fabiano Bezerra MENEGIDIO et al
65º Congresso Brasileiro de Genética
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LS
Genetics
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| 2019 |
Trabalho em evento |
Characterization of promoters elements responsive to the quorum sensing (qs) in Zymomonas mobilis
Silva Juliana De Fátima SANTOS; Alencar Valquíria CAMPOS; Vilas Boas Renata OZELAMI; Fabiano Bezerra MENEGIDIO; Aciole Barbosa DAVID et al
65º Congresso Brasileiro de Genética
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LS
Genetics
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| 2019 |
Trabalho em evento |
Ampflow: a containerized pipeline to assist in reproducible and replicable microbiome research
Fabiano Bezerra MENEGIDIO; Aciole Barbosa DAVID; Faustino De Maria Yara Natércia LIMA; Gonçalves Rafael Dos S; Marcos Vinicius YANO et al
X-Meeting 2019 - 15th International Conference of the AB3C.
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LS
Microbiology
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| 2019 |
Trabalho em evento |
Análise de replicabilidade e reprodutibilidade de um fluxo de trabalho para análises de microbioma utilizando dados de videiras apresentando sintomas da doença galha-de-coroa
Marcos Vinicius YANO; Fabiano Bezerra MENEGIDIO; Luiz Roberto NUNES
XXII Congresso de Iniciação Cientifica da Universidade de Mogi das Cruzes
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LS
Microbiology
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| 2019 |
Trabalho em evento |
Análise funcional do microbioma intestinal de camundongos durante o desenvolvimento de caquexia induzida por transplante de células de câncer pulmonar (llc)
Gonçalves Rafael Dos S; Fabiano Bezerra MENEGIDIO; Luiz Roberto NUNES
XXII Congresso de Iniciação Cientifica da Universidade de Mogi das Cruzes
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LS
Biochemistry
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| 2019 |
Trabalho em evento |
Análise da composição do microbioma intestinal de camundongos durante o desenvolvimento de caquexia induzida por transplante de células de câncer pulmonar (LLC)
Faustino De Maria Yara Natércia LIMA; Fabiano Bezerra MENEGIDIO; Aciole Barbosa DAVID; De Souza Lucas RODRIGO; Kaltinaitis Benetton Nunes Hypolito Dos SANTOS et al
XXII Congresso de Iniciação Cientifica da Universidade de Mogi das Cruzes
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LS
Molecular Biology
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| 2019 |
Trabalho em evento |
Padronização de metodologia para isolamento de particulas virais do intestino de camundongos com vistas à análise de viroma
De Souza Lucas RODRIGO; Fabiano Bezerra MENEGIDIO; Aciole Barbosa DAVID; Costa De Oliveira REGINA; Luiz Roberto NUNES et al
XXII Congresso de Iniciação Cientifica da Universidade de Mogi das Cruzes
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LS
Microbiology
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| 2019 |
Artigo em periódico |
Bioportainer Workbench: a versatile and user-friendly system that integrates implementation; management; and use of bioinformatics resources in Docker environments
Fabiano Bezerra MENEGIDIO; Aciole Barbosa DAVID; Gonçalves Rafael Dos S; Nishime Marcio M; Jabes Daniela L et al
GigaScience
DOI 10.1093/gigascience/giz041
ISSN 2047-217X
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LS
Biotechnology
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| 2019 |
Artigo em periódico |
ParaDB: A manually curated database containing genomic annotation for the human pathogenic fungi Paracoccidioides spp.
Aciole Barbosa DAVID; Fabiano Bezerra MENEGIDIO; Alencar Valquíria CAMPOS; Gonçalves Rafael S; Silva Juliana De Fátima SANTOS et al
PLoS Neglected Tropical Diseases
DOI 10.1371/journal.pntd.0007576
ISSN 1935-2735
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LS
Microbiology
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| 2018 |
Trabalho em evento |
Bioportainer: a Portainer fork; carrying templates for lightweight graphic management of bioinformatics-related docker environments
Fabiano Bezerra MENEGIDIO; David Aciole BARBOSA; Jabes Daniela L; De Oliveira Regina COSTA; Luiz Roberto NUNES
X-Meeting 2018 - 14th International Conference of the AB3C;
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PS
Computer Science Applications
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| 2018 |
Artigo em periódico |
Dugong: a Docker image; based on Ubuntu Linux; focused on reproducibility and replicability for bioinformatics analyses
Fabiano Bezerra MENEGIDIO; Jabes Daniela L; Costa De Oliveira REGINA; Nunes Luiz R
Bioinformatics
DOI 10.1093/bioinformatics/btx554
ISSN 1460-2059
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PS
Computer Science (miscellaneous)
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| 2017 |
Artigo em periódico |
Functional and Evolutionary Characterization of a UDP-Xylose Synthase Gene from the Plant Pathogen Xylella fastidiosa</i> ; Involved in the Synthesis of Bacterial Lipopolysaccharide
Alencar Valquíria CAMPOS; Daniela Leite JABES; Fabiano Bezerra MENEGIDIO; Sassaki Guilherme LANZI; De Souza Lucas RODRIGO et al
BIOCHEMISTRY
DOI 10.1021/acs.biochem.6b00886
ISSN 0006-2960
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LS
Molecular Biology
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